Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCINQ13939 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCINQ13939 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCINQ13939 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCINQ13939 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCINQ13939 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCINQ13939 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCINQ13939 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCINQ13939 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCINQ13939 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCINQ13939 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCINQ13939 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCINQ13939 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCINQ13939 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCINQ13939 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCINQ13939 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCINQ13939 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCINQ13939 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCINQ13939 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCINQ13939 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCINQ13939 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCINQ13939 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCINQ13939 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCINQ13939 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCINQ13939 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCINQ13939 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCINQ13939 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCINQ13939 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCINQ13939 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCINQ13939 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCINQ13939 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCINQ13939 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCINQ13939 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCINQ13939 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCINQ13939 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCINQ13939 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCINQ13939 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCINQ13939 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCINQ13939 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCINQ13939 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCINQ13939 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCINQ13939 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCINQ13939 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCINQ13939 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCINQ13939 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCINQ13939 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCINQ13939 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCINQ13939 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCINQ13939 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCINQ13939 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCINQ13939 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCINQ13939 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCINQ13939 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCINQ13939 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCINQ13939 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCINQ13939 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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CCINQ13939 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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CCINQ13939 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CCINQ13939 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CCINQ13939 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CCINQ13939 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CCINQ13939 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCINQ13939 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCINQ13939 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCINQ13939 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCINQ13939 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCINQ13939 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CCINQ13939 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CCINQ13939 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCINQ13939 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCINQ13939 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CCINQ13939 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
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CCINQ13939 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCINQ13939 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCINQ13939 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCINQ13939 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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CCINQ13939 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCINQ13939 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCINQ13939 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCINQ13939 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CCINQ13939 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CCINQ13939 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCINQ13939 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCINQ13939 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CCINQ13939 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCINQ13939 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCINQ13939 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCINQ13939 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCINQ13939 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCINQ13939 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCINQ13939 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCINQ13939 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CCINQ13939 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCINQ13939 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCINQ13939 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
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