Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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