Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
TUBA3CQ13748 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TUBA3CQ13748 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
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