Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATP1A4Q13733 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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