Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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