Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATMQ13315 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATMQ13315 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATMQ13315 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATMQ13315 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ATMQ13315 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ATMQ13315 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ATMQ13315 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ATMQ13315 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ATMQ13315 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ATMQ13315 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ATMQ13315 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ATMQ13315 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATMQ13315 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATMQ13315 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATMQ13315 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATMQ13315 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATMQ13315 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATMQ13315 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATMQ13315 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATMQ13315 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATMQ13315 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATMQ13315 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATMQ13315 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATMQ13315 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATMQ13315 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
ATMQ13315 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
ATMQ13315 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
ATMQ13315 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
ATMQ13315 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC-1.66□□□□□ -2.67
ATMQ13315 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
ATMQ13315 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
ATMQ13315 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ATMQ13315 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ATMQ13315 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ATMQ13315 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ATMQ13315 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATMQ13315 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATMQ13315 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATMQ13315 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATMQ13315 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATMQ13315 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATMQ13315 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
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