Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SEMA3FQ13275 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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