Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RPA4Q13156 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.68□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RPA4Q13156 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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