Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRDNQ13061 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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TRDNQ13061 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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TRDNQ13061 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
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TRDNQ13061 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TRDNQ13061 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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