Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PRDM2Q13029 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PRDM2Q13029 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRDM2Q13029 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRDM2Q13029 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRDM2Q13029 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRDM2Q13029 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRDM2Q13029 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRDM2Q13029 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRDM2Q13029 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRDM2Q13029 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRDM2Q13029 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRDM2Q13029 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRDM2Q13029 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRDM2Q13029 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRDM2Q13029 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRDM2Q13029 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRDM2Q13029 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRDM2Q13029 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
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