Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFRD2Q12894 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
IFRD2Q12894 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFRD2Q12894 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
IFRD2Q12894 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFRD2Q12894 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFRD2Q12894 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFRD2Q12894 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IFRD2Q12894 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFRD2Q12894 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFRD2Q12894 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFRD2Q12894 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFRD2Q12894 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFRD2Q12894 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFRD2Q12894 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFRD2Q12894 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFRD2Q12894 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFRD2Q12894 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFRD2Q12894 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IFRD2Q12894 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
IFRD2Q12894 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
IFRD2Q12894 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
IFRD2Q12894 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
IFRD2Q12894 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFRD2Q12894 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFRD2Q12894 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFRD2Q12894 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFRD2Q12894 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFRD2Q12894 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFRD2Q12894 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFRD2Q12894 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFRD2Q12894 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IFRD2Q12894 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
IFRD2Q12894 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151 ms