Protein–RNA interactions for Protein: Q10713

PMPCA, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCAQ10713 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PMPCAQ10713 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PMPCAQ10713 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms