Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TFF3Q07654 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC-2.51□□□□□ -2.81
TFF3Q07654 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TFF3Q07654 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TFF3Q07654 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TFF3Q07654 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TFF3Q07654 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TFF3Q07654 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TFF3Q07654 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TFF3Q07654 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TFF3Q07654 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-2.53□□□□□ -2.81
TFF3Q07654 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TFF3Q07654 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TFF3Q07654 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TFF3Q07654 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-2.53□□□□□ -2.81
TFF3Q07654 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TFF3Q07654 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TFF3Q07654 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TFF3Q07654 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TFF3Q07654 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-2.54□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-2.56□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC-2.56□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC-2.56□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-2.57□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC-2.57□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-2.57□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-2.57□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-2.58□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC-2.58□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC-2.58□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-2.58□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TFF3Q07654 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
TFF3Q07654 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
TFF3Q07654 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
TFF3Q07654 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
TFF3Q07654 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
TFF3Q07654 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
TFF3Q07654 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
TFF3Q07654 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
TFF3Q07654 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
TFF3Q07654 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC-2.61□□□□□ -2.83
TFF3Q07654 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
TFF3Q07654 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
TFF3Q07654 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
TFF3Q07654 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
TFF3Q07654 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
TFF3Q07654 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
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