Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PGGT1BP53609 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PGGT1BP53609 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
PGGT1BP53609 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PGGT1BP53609 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PGGT1BP53609 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PGGT1BP53609 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PGGT1BP53609 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PGGT1BP53609 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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PGGT1BP53609 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PGGT1BP53609 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PGGT1BP53609 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PGGT1BP53609 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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PGGT1BP53609 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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PGGT1BP53609 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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PGGT1BP53609 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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PGGT1BP53609 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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PGGT1BP53609 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
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PGGT1BP53609 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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PGGT1BP53609 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
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PGGT1BP53609 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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PGGT1BP53609 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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PGGT1BP53609 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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