Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LRRTM2O43300 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199 ms