Protein–RNA interactions for Protein: H7C1Q1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1Q1 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
H7C1Q1 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
H7C1Q1 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
H7C1Q1 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
H7C1Q1 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
H7C1Q1 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
H7C1Q1 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
H7C1Q1 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
H7C1Q1 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
H7C1Q1 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H7C1Q1 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H7C1Q1 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H7C1Q1 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H7C1Q1 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
H7C1Q1 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H7C1Q1 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H7C1Q1 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H7C1Q1 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
H7C1Q1 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
H7C1Q1 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
H7C1Q1 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
H7C1Q1 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
H7C1Q1 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
H7C1Q1 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H7C1Q1 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H7C1Q1 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H7C1Q1 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H7C1Q1 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H7C1Q1 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H7C1Q1 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H7C1Q1 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
H7C1Q1 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H7C1Q1 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
H7C1Q1 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
H7C1Q1 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
H7C1Q1 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H7C1Q1 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H7C1Q1 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H7C1Q1 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H7C1Q1 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H7C1Q1 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H7C1Q1 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H7C1Q1 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H7C1Q1 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H7C1Q1 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H7C1Q1 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H7C1Q1 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
H7C1Q1 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms