Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
CCDC180Q9P1Z9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms