Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF541Q9H0D2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF541Q9H0D2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms