Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE41Q9C0J9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms