Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP31Q70CQ4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms