Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC141Q6ZP82 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms