Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Odf1Q61999 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Odf1Q61999 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Odf1Q61999 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Odf1Q61999 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Odf1Q61999 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Odf1Q61999 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Odf1Q61999 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Odf1Q61999 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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