Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms