Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms