Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDN3

Gm45902, Predicted gene 45902, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45902Q3UDN3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm45902Q3UDN3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm45902Q3UDN3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms