Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1SQ13698 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
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