Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNTNAP1P78357 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTNAP1P78357 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms