Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab17P35292 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab17P35292 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab17P35292 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms