Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNTO95613 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNTO95613 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNTO95613 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNTO95613 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNTO95613 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNTO95613 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNTO95613 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNTO95613 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNTO95613 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCNTO95613 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCNTO95613 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCNTO95613 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCNTO95613 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCNTO95613 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCNTO95613 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCNTO95613 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCNTO95613 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCNTO95613 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNTO95613 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNTO95613 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNTO95613 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNTO95613 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNTO95613 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNTO95613 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNTO95613 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNTO95613 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNTO95613 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNTO95613 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNTO95613 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNTO95613 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNTO95613 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNTO95613 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNTO95613 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNTO95613 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNTO95613 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNTO95613 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNTO95613 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNTO95613 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNTO95613 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNTO95613 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNTO95613 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNTO95613 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNTO95613 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNTO95613 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNTO95613 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNTO95613 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNTO95613 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNTO95613 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNTO95613 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNTO95613 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNTO95613 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNTO95613 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNTO95613 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNTO95613 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNTO95613 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNTO95613 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNTO95613 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNTO95613 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNTO95613 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNTO95613 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNTO95613 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNTO95613 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNTO95613 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNTO95613 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNTO95613 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNTO95613 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNTO95613 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNTO95613 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNTO95613 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNTO95613 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNTO95613 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNTO95613 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNTO95613 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNTO95613 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNTO95613 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms