Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AurkcO88445 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AurkcO88445 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AurkcO88445 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms