Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSB3

Gm3880, Predicted pseudogene 3880, mousemouse

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Length 72 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3880A0A1B0GSB3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Gm3880A0A1B0GSB3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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