Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SH3BP1Q9Y3L3 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP1Q9Y3L3 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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