Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FAM53CQ9NYF3 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms