Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ARHGEF4Q9NR80 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF4Q9NR80 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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