Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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