Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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ATG4CQ96DT6 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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ATG4CQ96DT6 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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