Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Q1T7F1 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Q1T7F1 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Q1T7F1 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Q1T7F1 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Q1T7F1 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Q1T7F1 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Q1T7F1 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
Q1T7F1 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Q1T7F1 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Q1T7F1 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Q1T7F1 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Q1T7F1 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Q1T7F1 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
Q1T7F1 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Q1T7F1 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Q1T7F1 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Q1T7F1 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Q1T7F1 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Q1T7F1 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Q1T7F1 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Q1T7F1 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Q1T7F1 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Q1T7F1 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Q1T7F1 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Q1T7F1 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Q1T7F1 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Q1T7F1 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
Q1T7F1 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Q1T7F1 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Q1T7F1 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Q1T7F1 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Q1T7F1 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Q1T7F1 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Q1T7F1 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
Q1T7F1 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Q1T7F1 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Q1T7F1 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Q1T7F1 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Q1T7F1 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Q1T7F1 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Q1T7F1 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 489.2 ms