Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDO1Q16878 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CDO1Q16878 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDO1Q16878 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDO1Q16878 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDO1Q16878 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDO1Q16878 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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