Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms