Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

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Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC-1.1□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
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