Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
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