Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS72Q15906 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
VPS72Q15906 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
VPS72Q15906 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
VPS72Q15906 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
VPS72Q15906 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPS72Q15906 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPS72Q15906 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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