Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC85BQ15834 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
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