Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NPTX1Q15818 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NPTX1Q15818 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.8 ms