Protein–RNA interactions for Protein: Q15583

TGIF1, Homeobox protein TGIF1, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF1Q15583 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TGIF1Q15583 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TGIF1Q15583 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms