Protein–RNA interactions for Protein: Q15287

RNPS1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1Q15287 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RNPS1Q15287 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms