Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC3Q15034 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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