Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL19A1Q14993 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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COL19A1Q14993 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL19A1Q14993 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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