Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMCO1Q147U7 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMCO1Q147U7 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
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