Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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